В ноябре 2003 года в КамчатНИРО была организована новая лаборатория гидробиологии и трофологии, которая объединила специалистов, изучающих кормовую базу и питание рыб и беспозвоночных из всех подразделений института. В том же году данная лаборатория вошла в состав отдела фоновых исследований, а в 2009 году она была переименована в лабораторию гидробиологии.  В 2019 году лаборатория преобразована в сектор. С момента создания и по 2012 год лабораторией руководил д.б.н. В.В. Максименков. В настоящее время и.о. заведующего сектором  является к.б.н. Е.В. Лепская.

Коллектив  сектора  ведет исследования по трем основным направлениям:

Первое — это изучение планктонных и бентосных сообществ прикамчатских вод для оценки состояния кормовой базы и питания морских рыб и беспозвоночных, как основы формирования продуктивности их промысловых популяций. Для этого ежегодно сотрудники лаборатории организуют и принимают участие в морских экспедициях в Охотском и Беринговом морях и в тихоокеанских водах Камчатки, которые выполняются по программам КамчатНИРО. 

 ^{Сбор зоопланктона и бентоса в море}

^{Распределение биомасы иглокожих, полихет, двустворчатых моллюсков и разноногих ракообарзных на шельфе Авачинского залива в мае 2011 г.}

Второе — экосистемный мониторинг Авачинской бухты, с целью оперативной оценки ее состояния. Для этого в безледный период с апреля по октябрь сотрудники лаборатории отбирают пробы фито, зоо- и ихтиопланктона, а также зообентоса и изучают состояние биоты на 10 станциях, расположенных в центральной части и по периметру бухты в тех частях акватории, которые испытывают антропогенный прессинг. Мониторинг Авачинской бухты лаборатория гидробиологии проводит совместно с лабораторией океанографии и гидрологии пресных вод и лабораторией здоровья гидробионтов. Ежегодно делается комплексное заключение о состоянии Авачинской губы. Оперативно, через средства массовой информации население извещается о появлении «красных приливов» и токсичных микроводорослей в целях предотвращения возможных отравлений людей морепродуктами, выловленными в это время в бухте.

 

 

^{Среднемноголетние и среднегодовые значения численности фитопланктона и биомассы зоопланктона в пелагиали оз. Азабачье за летне-осенние месяцы 1981–2012 гг. (1981–2010 гг. — среднемноголетние показатели)}

^{Межгодовые изменения биомассы кормового зоопланктона и массы тела основной группы смолтов молоди нерки возраста 2+ в оз. Курильское}

 

^{Эксперимент (1) и его результаты (2, 3) по оценке скорости и времени поступления фосфора и других биогенных элементов в оз. Курильское из тел отнерестовавшей нерки}

Третье — мониторинг экосистем и исследования биопродукционных процессов пресноводных водоемов рыбохозяйственного значения Камчатского полуострова, оценка воздействия природных и антропогенных факторов среды на формирование ресурсов тихоокеанских лососей Камчатки.

По данному направлению, каждый год сотрудники лаборатории проводят исследования кормовой базы молоди лососевых рыб в основных нерестовых водоемах Камчатки: озерах Курильское, Азабачье, Паланское, Начикинское, Лиственничное, Дальнее, озер Корякского нагорья и Толмачёвское водохранилище, водоемах, расположенных на территории ООПТ, а также в многочисленных лососевых реках полуострова. Собирают данные о численности и биомассе планктонных организмов, определяющих обеспеченность пищей, трофических звеньев разного уровня, в том числе, молоди лососей в разных биотопах нагульных водоемов.

Эти исследования направлены на получение разносторонней информации о процессах, происходящих в нерестово-выростных озерах, с целью выявления фундаментальных закономерностей функционирования экосистем лососевых озер, и, в конечном результате, на повышение эффективности использования их ресурсов в целях рационального ведения лососевого промысла.